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黄大仙码报华中农大构建辣椒不同栽培种及变种

更新时间:2019-10-05

  原标题:华中农大构建辣椒不同栽培种及变种的泛质体基因组 Hortres Article

  辣椒是世界上最重要的农作物之一,同时是我国栽培面积第一的蔬菜。辣椒属植物大约有32个野生种和5个栽培种。栽培辣椒的分类始终是一个令人困扰的问题,目前主要利用基于种子颜色、花冠颜色和形状、花丝颜色以及每节花数等几个典型植物学性状将辣椒分为5个栽培种。基于种间亲和性,栽培种进一步归为3个复合群(A、B和P)。染色体核型分析和分子系统发育研究表明3个类群辣椒的起源地各不相同。虽然根据核型分析能够分出辣椒属中的A复合群材料,但是从分子水平清晰区分各种类栽培辣椒的问题仍然有待解决。同时,一年生栽培辣椒(Capsicum annuum)是辣椒属中衍生分枝最多的类型,但在A复合群内不同变种辣椒之间的关系也不甚清楚。在高等植物中,叶绿体基因组序列包含的基因位点是解决分类问题的首选,其中matk和rbcL等基因通常优先用来解决分类问题。然而,韩乔生:U16女足0-2不敌日本失望的是结果绝望的是过程!118kj开,亲缘关系密切的种或变种之间在叶绿体特定基因上通常缺乏变异。随着高通量测序技术的出现,根据测序数据可以组装质体基因组,并具有广泛用途。

  该研究从大量辣椒重测序样本中,成功组装和分析了321个叶绿体基因组,进一步构建了辣椒5个栽培种及2个变种的叶绿体泛基因组(下图)。系统发育信号分析揭示了辣椒属不同种间亲缘关系的远近。对7个叶绿体泛基因组的CDS、内含子和基因间隔区遗传多样性进行了详尽分析,确定rpl23和trnI的基因间隔区包含44 bp串联重复已经其他插入缺失和单核苷酸等丰富的变异。在此技术上开发了适合于琼脂糖凝胶电泳分辨率的分子标记,请问一下纵横中文网 的黑榜和红榜 是什,能够用于区分复合群A和B及其分支,鉴定不同种及变种的栽培辣椒。此外,该研究还发现包括GenBank中提供了线粒体基因组数据的相当一部分辣椒种质归类标识错误的问题。

  华中农业大学园艺植物生物学学教育部重点实验室欧阳波教授为该论文的通讯作者,博士后Mahmoud Magdy为该论文的第一作者。

  近年来,黄大仙码报,该研究组与湖南农业大学邹学校院士团队、园艺植物生物学学教育部重点实验室李峰教授研究组以及华智水稻等联合开展了辣椒基础研究,已发表多篇高水平文章,包括1篇Mol Plant(PepperHub数据库)、1篇Plant J、1篇New Phytol和该篇Hortic Res,推动了我国的辣椒基础研究。


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